Der Vorstand des Fach- und Führungskräfteverbandes leitet die Geschicke des Verbandes. Er besteht aus dem Vorsitzenden, seinem Stellvertreter, dem Schatzmeister und bis zu zehn weiteren Mitgliedern. Bei der Zusammensetzung des Vorstandes werden nach Möglichkeit eine ausgewogene Vertretung der Kammerorganisation innerhalb des Bundesgebietes sowie eine Berücksichtigung der anerkannten deutschen Auslandshandelskammern und Delegiertenbüros angestrebt.
Der Vorsitzende des Verbandes führt die laufenden Geschäfte und vertritt den Verband sowohl in der Öffentlichkeit als auch rechtsgeschäftlich und gerichtlich.
In den mehrfach jährlich stattfindenden Vorstandssitzungen werden die Aufgaben des FKV bearbeitet. In den Sitzungen werden auch Neumitglieder aufgenommen, wenn sie zuvor einen Aufnahmeantrag gestellt haben und die satzungsgemäßen Kriterien erfüllen. In der jährlichen Mitgliederversammlung im Rahmen des Kollegentages wird zudem ein Tätigkeitsbericht über die Arbeit des Vorstandes vorgelegt.